Microsoft: Almacenamiento de datos digitales en ADN

Microsoft ya es capaz de almacenar 200 MB de datos digitales en ADN

http://www.actualidadgadget.com/ 14/07/2016

Desde hace bastante tiempo sabemos que en Microsoft están más que interesados en encontrar nuevas formas para almacenar datos digitales, en esta ocasión y gracias a la colaboración establecida con la Universidad de Washington, se ha conseguido ir más allá y establecer un nuevo récord en cuanto a almacenamiento de datos digitales en ADN. Concretamente y según los resultados expuestos, los investigadores han conseguido codificar y descodificar 200 MB en hebras sintéticas de genes y guardarlas en un tubo de ensayo.

La imagen que puedes ver en pantalla es precisamente el tubo de ensaño donde ha sido almacenada este ADN tratado. En la misma foto aparece un lápiz con el único fin de que cualquiera que vea la foto aprecie el tamaño tan pequeño que tiene este conjunto de genes. Como detalle, comentarte que en esos 200 MB no hay un archivo cualquiera, sino que los investigadores han codificado y descodificado nada menos que la Declaración Universal de los Derechos Humanos en más de 100 idiomas, los 100 mejores libros del Proyecto Gutenberg, una pequeña base de datos e incluso un vídeo musical del grupo OK Go!.

Microsoft espera ser capaz de almacenar hasta 1.000 millones de TB en un gramo de ADN

Según unas declaraciones realizadas por Karin Strauss, líder del proyecto:

Nos interesa averiguar si podemos crear un sistema extremo a extremo basado en ADN que pueda almacenar datos, que se automático y que pueda ser utilizado por empresas.

Las necesidades de almacenamiento de datos no paran de crecer, debido a esto, no es de extrañar que varios grupos de científicos estén estudiando nuevas formas de almacenamiento de datos digitales. Uno de estos es el ADN, material genético que puede ser un soporte ideal debido a que es posible escribir en moléculas con unaconcentración mayor que en las tecnologías de almacenamiento convencionales.

De momento los investigadores y científicos de ambas organizaciones esperan seguir avanzando en su aprendizaje y desarrollando la tecnología que les permita, según Microsoft, almacenar 1.000 millones de terabytes de datos en un solo gramo de ADN.

Más información: MIT

Autor: Juan Luis Arboledas

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Científicos se proponen conseguir una densidad de almacenamiento de 1 exabyte por milímetro cúbico de ADN

Es posible almacenar hasta 10 TB de archivos digitales en el ADN

http://hoyentec.com/ 12/04/2016

La meta del proyecto es conseguir una densidad de almacenamiento de 1 exabyte por milímetro cúbico de ADN.

Con el paso del tiempo, la necesidad que tenemos de almacenar datos aumenta a un paso muy rápido, y de la mano con esto, la capacidad de los soportes de almacenamiento también debe aumentar a la misma velocidad. Aunque actualmente los datos pueden ser almacenados de forma mucho más compacta que hace pocos años, las unidades de almacenamiento utilizan cada vez más espacio, y las compañías están buscando formas muy creativas de ahorrar ese espacio. Microsoft, por ejemplo, está siendo pionera en llevas centros de datos a las profundidades del mar.

Pero un grupo de científicos de Washington quieren incluso cambiar los dispositivos para almacenar la información y usar algo que los seres humanos tenemos en abundancia: el ADN: “La vida ha producido esta fantástica molécula denominada ADN, que de manera eficaz almacena todo tipo de información sobre los genes y el funcionamiento de un organismo vivo. Es un sistema altamente compacto y eficaz”, escribe Luis Cexe, profesor de planta de la Universidad de Washington, en un comunicado en el que se explican los resultados de su investigación. Cexe participa, junto con un grupo de científicos, en un grupo de investigación que ha desarrollado un sistema capaz de codificar, almacenar y extraer datos binarios utilizando moléculas de ADN.

Según un artículo en donde se detalla la ampitud y los objetivos de la investigación, la meta del proyecto es conseguir una densidad de almacenamiento de 1 exabyte por milímetro cúbico de ADN; es decir, 1000 millones de GB por cada milímetro cúbico. Para los investigadores, esta densidad es 1 millón de veces superior a la que es posible alcanzar con las actuales tecnologías de almacenamiento. Paralelamente, el ADN tiene la capacidad de conservar la información durante cientos de años, incluso en condiciones altamente desfavorables, no así las máquinas hasta ahora hechas por el hombre. Esta es precisamente la causa que este tipo de almacenamiento permanente represente un mayor potencial de funcionabilidad para los sistemas basados en ADN.

Sin duda alguna, esto sería uno de los mayores logros de la ciencia en los últimos tiempos, y sus resultados ayudarían mucho a la expansión de almacenamiento de todos los datos que hoy en día necesitamos, y ni hablar de los que necesitaremos en el futuro.

Autor: Luis Mario López

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El material de los pergaminos también guarda su historia

La vía para revelar las historias ocultas de los pergaminos

http://noticiasdelaciencia.com/ 05/07/2015

En los viejos pergaminos no solo es valiosa la información escrita que contienen, sino también la que alberga el propio material en sí mismo. Muchos manuscritos medievales fueron escritos sobre pergaminos, hechos con pieles de animales, y la estrategia de extraer y analizar el ADN contenido en estas pieles permite obtener datos genéticos capaces de revelar con bastante fiabilidad cuándo y dónde se escribió un manuscrito. Cada manuscrito puede aportar una rica cantidad de datos genéticos, porque un libro medieval típico en pergamino puede incluir pieles de varias docenas de animales o hasta quizá incluso más de cien.

Una nueva técnica de análisis de ADN encontrado en pergaminos antiguos podría ser la clave para rastrear el desarrollo de la ganadería y la agricultura a lo largo de los siglos, según una nueva investigación realizada por el equipo de Daniel Bradley, del Trinity College de Dublín en Irlanda.

Gracias a los avances en técnicas de secuenciación genética, los importantísimos relatos históricos que estos documentos nos cuentan ya no quedan confinados a sus textos; ahora, el ADN del pergamino en el que fueron escritos también proporciona información vital.

Los autores del nuevo estudio usaron estas técnicas científicas de vanguardia para extraer proteínas y ADN antiguos de muestras diminutas, procedentes de pergaminos de documentos que van de finales del siglo XVII a finales del XVIII. La información resultante les permitió establecer el tipo de animales a partir de los cuales se hizo el pergamino, lo cual, cuando se hacen comparaciones con los genomas de sus equivalentes modernos, proporciona datos clave sobre cómo dio forma la expansión ganadera y agrícola a la diversidad genética de estos animales.

La investigación demuestra pues que es factible “leer” la historia oculta subyacente en cada pergamino, al menos si este se halla en condiciones no demasiado malas.

Pergamino del siglo XIV. (Foto: Cortesía del Borthwick Institute for Archives)

Antes de que comenzase la fabricación de papel a gran escala, el pergamino era el medio principal para los documentos legales, y hasta la adopción generalizada de las máquinas de escribir, eran el medio preferido de los notarios para muchos documentos y registros de índole legal.

Los pergaminos tienen una serie de propiedades que los hacen un material muy adecuado para la extracción de ADN y su análisis.

En primer lugar, están hechos de pieles de animales domésticos, en especial ganado, y su fabricación da como resultado artículos robustos, que pueden sobrevivir intactos durante muchos siglos.

En segundo lugar, son abundantes, y debido a su valor legal duradero, han sido por lo general tratados con cuidado. En el siglo XX, ello incluyó protegerlos tanto de las altas temperaturas como de las fluctuaciones en la humedad.

En tercer lugar, a diferencia de los restos óseos, de los que solo se ha desenterrado un pequeño porcentaje, los pergaminos se hallan por encima del suelo, y en el caso de los documentos legales, están relacionados directamente con fechas específicas, un nivel de resolución que es casi imposible de conseguir con cualquier otra fuente histórica de ADN.

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Google Genomics proyecto para crear una especie de Internet del ADN

Google también quiere almacenar tu información genética
http://bitelia.com/ 17/11/2014

Google Genomics es un proyecto para crear una especie de Internet del ADN en el que los médicos podrán buscar información relacionada con el genoma humano y podrán realizar consultas para avanzar en el desarrollo de investigaciones en el campo de la salud.

Google es una de las empresas más grandes y acaparadoras del mundo. Gracias a sus productos y servicios podemos realizar búsquedas en Internet, tener una cuenta de correo electrónico, almacenar archivos en la nube, tener un perfil social, escuchar música y ver videos, crear documentos de texto, tener un navegador de Internet, tener un sistema operativo completo, entre otras muchas, muchas, muchas, muchas (...) posibilidades.

Uno de los campos en el que pocas empresas desarrolladoras de tecnología han incursionado es la genética; y es que, quién pensaría que se puede realizar algo respecto a la genética, bueno Google ya lo hizo.
Google Genomics

La secuencia genética completa de una sola persona produce más de 100GB de datos en bruto.

Gracias a los avances tecnológicos, la generación de datos en la investigación científica es mucho más fácil que antes; sin embargo, el análisis y la interpretación siguen siendo aspectos un poco más complejos debido al constante aumento del volumen de información.

Google ha creado un convenio con la Alianza Global para la Genética y la Salud (Global Alliance), que permitirá "elintercambio responsable, seguro y eficaz de la información genética y clínica en la nube con las comunidades de investigación y cuidado de la salud, en cumplimiento con los más altos estándares de ética y privacidad."

Google Genomics forma parte de la plataforma Google Cloud, el cual permite a los desarrolladores crear, probar e implementar aplicaciones sobre la infraestructura de Google. El proyecto se puso en marcha en marzo de este año, pero no tuvo tanto impacto como otros anuncios de Google.

Google Genomics es un proyecto completo que incluye el almacenamiento de información genética en la nube, un buscador especializado y la posibilidad de realizar consultas respecto de dicha información para ayudar a los especialistas de la salud en el desarrollo de experimentos, estudios sobre determinada población genética o el descubrimiento de curas y tratamientos. Lo más importante es que la medicina pronto podrá contar con una especie de Internet del ADN en el que los médicos serán capaces de realizar búsquedas.

Por ejemplo, si yo fuera a contraer cáncer de pulmón en el futuro, los médicos van a secuenciar mi genoma y el genoma de mi tumor y, a continuación, realizarán consultas contra una base de datos de 50 millones de genomas. El resultado será 'Oye, aquí está el medicamento que funciona mejor para ti.' - Deniz Kural

Actualmente ya se pueden encontrar 3,500 genomas de proyectos públicos en los servidores de Google. El costo de almacenamiento de cada genoma varía entre $25 y $0.25 dólares por año, aunque se estima que entre más crezca la demanda los costos disminuirán.

Autor:  NASHELI ESCOBAR

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Los mejores inventos del 2014: impresora 3D y el Test rápido de ADN

La impresora 3D y el test rápido de ADN, entre los mejores inventos de 2014
http://www.ciudadanodiario.com.ar/ 07/07/2014

Berlín ha sido la sede de entrega de los premios Inventor Europeo 2014, que reconocen a aquellas personas o equipos que contribuyen al progreso social, económico y tecnológico a través de sus creaciones. La Oficina Europea de Patentes ha galardonado a Charles Hull, por la invención de la impresión en 3D, una tecnología que está provocando una auténtica revolución en la industria manufacturera, y a Christofer Toumazou, por su invención de un test de ADN rápido a través de un chip que se puede insertar en una USB y ver los resultados directamente en la pantalla.

El público ha querido premiar a Masahiro Hara, Takayuki Nagaya y su equipo por inventar el código QR, que se utiliza para la gestión de inventarios en fábricas, la administración de los archivos de pacientes, el seguimiento de muestras biológicas y como herramienta de márketing.

En 2015 se pondrá en marcha el Tribunal Europeo de Patentes y la Patente Unitaria Europea, que permitirá patentar una invención en un solo trámite.

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154 SONETOS DE SHAKESPEARE EN ALMACENAMIENTO DE ADN

Shakespeare y Martin Luther King demostrar el potencial de almacenamiento de ADN

http://www.guardian.co.uk/ 24/01/2013

Todos los sonetos de Shakespeare 154 se han explicado en el ADN para demostrar el enorme potencial de almacenamiento de datos genéticos

Fotografía: Oli Scarff / Getty

Cuando está escrito en el ADN, uno de los sonetos de Shakespeare pesa 0,3 millonésimas de una millonésima parte de un gramo.

Sus palabras han tocado el enamorado y ha sido estudiado minuciosamente por los adolescentes meditando desde hace más de cuatrocientos años, pero ahora algunos de los poemas más románticas jamás escritas se han escrito en la molécula de la vida.

Toda la colección de 154 sonetos de Shakespeare se ha explicado en el ADN por los científicos de Cambridge para demostrar el enorme potencial de almacenamiento genético. Cantidades enormes de información se puede escribir en partículas de ADN y se archivan durante decenas de miles de años, afirman los investigadores.

Junto sonetos del bardo, los científicos hicieron cadenas de ADN que parte almacenada de un archivo de audio de Martin Luther King 's 1963 discurso "Tengo un sueño", y el trabajo de investigación seminal que describió por primera vez la naturaleza doble hélice del ADN por Francis Crick y James Watson, una década antes.

Escrito en el ADN, uno de los sonetos de Shakespeare pesa 0,3 millonésimas de una millonésima parte de un gramo. Un gramo de ADN podría contener información tanto como más de un millón de CDs, dijeron los investigadores.

Nick Goldman y Ewan Birney en el Instituto Europeo de Bioinformática en Hinxton , cerca de Cambridge, se le ocurrió la idea en un pub en Hamburgo. Se preguntaban qué alternativas podrían existir en los discos duros y costosas cintas magnéticas utilizadas para almacenar las bases de datos crecientes que se están volviendo cada vez más común en la biología .

Ellos sabían que el ADN era una forma increíblemente eficiente y compacto para almacenar información, y se dedicó a idear una manera de convertir las moléculas en la memoria digital: capaz de codificar los 1s y 0s utiliza para almacenar palabras, imágenes, música y video en las computadoras.

"Escribimos en servilletas y esbozó los detalles, y se dio cuenta de que probablemente podría hacer esto", dijo Goldman.

Los científicos han desarrollado un código que utiliza las cuatro letras moleculares o "bases" de material genético - conocido como G, T, C y A - para almacenar información.

Digitales almacenan los datos contenidos en forma de cadenas de 1s y 0s. El código del equipo de Cambridge se vuelve cada bloque de ocho números en un código digital en cinco letras del ADN. Por ejemplo, el código de ocho dígitos binarios para la letra "T" se convierte en TAGAT.

Para almacenar palabras, los científicos sólo tiene que ejecutar las hebras de ADN cinco letras juntas. Así que la primera palabra: "Tú eres más hermoso y más templado" del soneto de Shakespeare 18, se convierte en TAGATGTGTACAGACTACGC.

Para probar el procedimiento, Goldman y Birney convirtió los sonetos, discurso de Martin Luther King, y el papel de Watson y Crick en su código genético nuevo y enviado por correo electrónico a una empresa de EE.UU. llama Agilent, que hace hebras de ADN físicas comercialmente para los investigadores. Varias semanas más tarde, la compañía volvió un tubo de ensayo pequeño para los científicos.Contenía una mota de ADN que codifica toda la información que había enviado.

Para asegurarse de que el ADN almacena la información correcta, los científicos de Cambridge se mezcla en una solución y lo pasó a través de una máquina de secuenciación de genes. A partir de eso, fueron capaces de leer los expedientes completos de nuevo, de acuerdo con un informe de la Naturaleza .
Una hazaña similar fue alcanzado por el genetista de Harvard, George Church, el año pasado. Se codificó una copia de su libro Regenesis, 11 imágenes, y un programa de ordenador en el ADN.

La obra Cambridge diferencia en la forma en que corrige los errores ortográficos se hicieron cuando el ADN está bien escrito o leído en el otro extremo. Cada "palabra" del código del ADN está escrito en cuatro formas diferentes, y hay millones de copias de cada uno de ellos.Cualquier error en el ADN pueden afectar sólo una minoría de los hilos de código, y estos se pueden observar mediante la comparación de ellos.

"Una de las grandes propiedades de ADN es que usted no necesita ninguna energía para almacenarla. Usted mantenerlo frío, seco y oscuro, y dura por un tiempo muy largo. Sabemos que debido a que habitualmente la secuencia de ADN de mamut lanudo que es mantenido por casualidad en ese tipo de condiciones ", dijo Birney.

El alto costo de hacer ADN hoy en día es el almacenamiento en genética biológicos unidades de disco duro no será práctico durante mucho tiempo. Pero Birney dijo que una gota más de 100 veces en el costo de la secuenciación del ADN, lo que ya ha sucedido en la última década, hace que el almacenamiento de ADN económico de la información que tiene que ser archivado por más de 50 años.

Consultado sobre si el ADN podría representar un peligro para la salud, si es que encontró su camino en una persona u otro animal, Goldman dijo: "El ADN que hemos creado no puede ser incorporada accidentalmente en un genoma, utiliza un código completamente diferente a la utilizada por las células de los organismos vivos. Si lo hizo terminar con todo esto del ADN dentro de ti que sólo sería degradado y eliminado. "

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NUEVA BASE DE DATOS PARA ARCHIVAR Y BUSCAR PERFILES DE ADN DE LAS MUESTRAS DE REFERENCIA DE ESCENAS DEL CRIMEN

Sorenson Forensics lanza una nueva base de datos basada en la nube para simplificar la escena del crimen de gestión de casos, los archivos de los perfiles de ADN
http://eon.businesswire.com/ 02/10/2012

SALT LAKE CITY - ( BUSINESS WIRE ) - Sorenson Forensics ha anunciado hoy el lanzamiento de su nuevo líder (ADN entrada accesible local) Database ™, un sistema seguro, basado en la nube de servicios diseñados para las agencias locales de aplicación de la ley para simplificar la búsqueda de archivos, y referencia de los perfiles de ADN de las muestras de la escena del crimen. El LEADDatabase ™ se dio a conocer durante el 2012 la Asociación Internacional de Jefes de Policía de la Conferencia en San Diego, California

"La base de datos nacional de ADN es controlado por el FBI, y mientras que los laboratorios federales, estatales y locales públicos crimen tienen acceso a su información, no es exhaustivo ni proporciona una base de datos local de información que se necesita", dijo Timothy D. Kupferschmid , director ejecutivo de Sorenson Forensics. "Con el Sorenson Forensics LEADDatabase ™, estamos dando el control local de los perfiles de ADN de los organismos encargados de hacer cumplir la ley. Esta solución permite a cada organismo la capacidad de manejar los gabinetes en una forma que se adapte mejor a sus necesidades individuales, y acelera el tiempo necesario para obtener la información necesaria para resolver los casos ".El Sorenson Forensics LEAD Database ™ ofrece a los agentes del orden público a nivel local el control que necesitan para archivar perfiles de ADN recogidas dentro de su jurisdicción que se facilita la búsqueda y la referencia a un usuario autorizado. Al centralizar los perfiles recogidos, los usuarios pueden acceder a la base de datos para comparar los perfiles de ADN en contra de la evidencia actual escena del crimen. Usando un sofisticado algoritmo, el LEAD Database ™ búsquedas perfiles existentes y automáticamente notificar a los usuarios cuando un perfil coincidente se identifica, lo que hay que resolver los crímenes con mayor rapidez.

Perfiles de ADN de las muestras de prueba se pueden cargar en forma manual el LEAD Database ™ a través de una conexión segura a Internet por un laboratorio estatal crimen local, o las muestras pueden enviarse al laboratorio forense Sorenson 'para ser analizados y se añade a la base de datos. Laboratorio forense de ADN avanzada Sorenson tiene el prestigioso ASCLD / LAB-International acreditación.

El LEAD Database ™ es ​​el último de una línea de servicios innovadores introducidos por Sorenson Forensics para ayudar mejor a las agencias locales de aplicación de la ley para resolver casos difíciles. En 2011, la compañía lanzó Investigación LEAD TM , la industria de pruebas de ADN ascendencia más avanzada para la aplicación de la ley. Desde su fundación en 2006, Sorenson Forensics ha desarrollado una reputación internacional para proporcionar servicios avanzados de ADN forense, incluyendo las pruebas de ADN y el análisis, testimonios de expertos, opiniones de ADN de casos, servicios de laboratorio de validación y pruebas de detección.

Para información de precios y adquisición en las Sorenson Forensics PLOMO Database ™, comuníquese con:salesinfo@sorensonforensics.com .

Sobre Sorenson Forensics

Sorenson Forensics ( www.sorensonforensics.com ) es un proveedor líder de servicios avanzados de ADN forenses y ofrece a la industria-mejor asistencia a los laboratorios de trabajo de casos de delitos federales, estatales y locales, funcionarios de asistencias de la corte en casos penales individuales, y ofrece servicios integrales de ADN forenses a clientes del sector privado. Sorenson Forensics ofrece servicios, tales como análisis de STR ​​y STR, Y-secuenciación de ADN mitocondrial; cribado biología integral, pruebas de serología completa, incluyendo sangre, semen y otros fluidos corporales de identificación, la consulta del caso de ADN, testimonios de expertos, servicios de validación y optimización de los servicios de laboratorio. El equipo de Sorenson Forensics consiste en individuos reconocidos internacionalmente por su amplia experiencia crimen público y privado laboratorio y por su rigor en los requisitos exigentes de trabajo de casos forenses. Forensics Sorenson ha establecido un récord extraordinario para ayudar a romper difíciles de resolver casos, incluidos previamente sin resolver "casos fríos".



Contactos


Sorenson Forensics Relaciones Públicas
Jacob Moon, 801-461-9797 jacob@methodcommunications.com o Sorenson Forensics Relaciones Públicas Alex Koritz, 801-461-9795alex@methodcommunications.com

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700 TERABYTES DE DATOS EN UN GRAMO DE ADN

Moby Dick en una cadena de adn. Harvard codifica los datos en el lenguaje de la vida

http://gigaom.com/ 18/08/2012
Investigadores del Instituto Wyss han roto todos los récords anteriores para el almacenamiento de ADN, que codifica 700 terabytes de datos en un gramo de ADN. ¿Por qué el almacenamiento de ADN? Es increíblemente densa y resistente, pero no es rápido (al menos no todavía), lo que haría más útil para el almacenamiento de archivos.

Imagine tomar la totalidad de la información digital del mundo - cerca de 1,8 zettabytes , según Harvard bioingeniero Sriram Kosuri - y su almacenamiento en materiales que pesan sólo 4 gramos. No sólo es posible, pero la tecnología ha existido desde hace miles de millones de años: el ADN.

Kosuri y genetista George Church, ambos investigadores de la Universidad de Harvard Instituto Wyss , se han codificado correctamente próximo libro Iglesia Regenesis: ¿Cómo la biología sintética va a reinventar la naturaleza de nosotros mismos en el ADN. Puede que no parezca gran cosa hasta que te das cuenta de que han replicado que tomo 70 mil millones de veces en un solo gramo de material biológico . Eso equivale a 700 terabytes de datos y 100 veces el número de libros impresos.

Usando los bloques de construcción de la vida como un medio de almacenamiento no es nuevo, pero de acuerdo con ExtremeTech , Iglesia y Kosuri logró meter información 1000 veces más en sus dobles hélices lo que se había logrado. Básicamente se utilizan las cuatro nucleobases los que definen código genético - adenina (A), citosina (C), guanina (G) y timina (T) - como marcadores binarios. Un C y se convierten en 0, y G y T convertido 1.

¿Por qué usar el ADN para almacenar datos digitales? ExtremeTech lo resume mejor:

Es increíblemente denso (que puede almacenar un bit por cada base, y una base es de sólo unos pocos átomos grande), es volumétrico (vaso) en lugar de plana (disco duro), y es increíblemente estable - en otras última generación como Doom medios de almacenamiento que mantenerse bajo cero vacíos, el ADN puede sobrevivir durante cientos de miles de años en una caja en el garaje.

Es sólo con los recientes avances en microfluidos y labs-on-a-chip que el ADN de síntesis y secuenciación se ha convertido en una tarea cotidiana, sin embargo. A pesar de que tomó años para el Proyecto del Genoma Humano originales para analizar un solo genoma humano (unos 3 mil millones de pares de bases de ADN), equipo de laboratorio moderno con chips de microfluidos puede hacerlo en horas . Ahora bien, esto no quiere decir que el almacenamiento de la Iglesia y Kosuri de ADN es rápido - pero es lo suficientemente rápido como para muy de largo plazo de archivo.

Imagen cortesía  de Flickr usuario  dullhunk

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CODIGO GENETICO NUEVA FORMA DE ALMACENAMIENTO DE INFORMACION DIGITAL

Pronto estarás copias de seguridad de su disco duro utilizando el ADN
http://io9.com/ 17/08/2012
Piensa en la tarjeta de memoria en su cámara es de alta capacidad? No tiene nada en el ADN. Con los datos que se acumula en un ritmo más rápido que cualquier otro punto en la historia humana, los científicos e ingenieros están mirando al código genético como una forma de próxima generación de almacenamiento de información digital.

Ahora, un equipo de la Universidad de Harvard y los genetistas de Johns Hopkins ha desarrollado un nuevo método de codificación de ADN que permite almacenar más información digital que nunca. Hablamos con el investigador principal, Sriram Kosuri para saber por qué el futuro del almacenamiento de datos de archivos es en el código genético, y por qué esquema de su equipo de la novela de codificación representa un paso tan importante hacia el potencial de aprovechamiento de ADN de almacenamiento enorme.
El problema de la

La humanidad tiene un problema de almacenamiento. Encuestas recientes llevadas a cabo porIDC Universo Digital sugieren que la perfusión de la tecnología en toda la sociedad ha provocado una explosión en el volumen de información que nosotros, como una especie producen sobre una base diaria. Entre fotos, videos, textos, tweets, actualizaciones de Facebook, no solicitados solicitudes FarmVille, puestos de Instagram y varias otras formas de producción digital de datos, la información del mundo se duplica cada dos años, y que plantea algunas cuestiones importantes, siendo el principal de ellos: cuando el el infierno no ponemos todo esto?

"En 2011 teníamos 1,8 * 10 21 bytes de información almacenados y replicados ", explica Sriram Kosuri, un genetista de la Universidad de Harvard y miembro de la plataforma de la biología sintética del Instituto Wyss , en un correo electrónico a io9. "Para el año 2020 será 50 veces más que eso es un número asombroso;. Y no incluye un conjunto mucho mayor de datos que se tiran (por ejemplo, video feeds)."

A tamaño completo

Como Kosuri señala, no toda esta información debe ser almacenada, pero - de ser los acaparadores diligentes pequeños que somos - una buena parte de ella se almacenan en caché en algún lugar para la posteridad, y al ritmo que está generando información, tendrá que encontrar nuevas soluciones de almacenamiento, si queremos tener alguna esperanza de mantenerse al día con nuestra demanda de espacio. "Nuestra capacidad para almacenar, administrar y archivar la información como está siendo constantemente tensas", señala Kosuri."Almacenamiento de los archivos también es un gran problema."

La solución (teórica): Las ventajas de almacenamiento de ADN

Almacenamiento de los archivos es donde entra en juego el ADN como medio de almacenamiento ir, es difícil competir con los bloques de construcción universales de la vida. En un artículo publicado en la edición de hoy de la Ciencia , Kosuri - en co-autoría con el genetista de Gao Yuan y el pionero de la biología sintética George Church - describe una nueva técnica para el uso de ADN para codificar la información digital en cantidades sin precedentes.Vamos a llegar a su método de almacenamiento de la novela en la siguiente sección, pero por ahora vamos a ver algunos números que ayudan a contextualizar lo que Kosuri identifica como los dos principales ventajas de almacenamiento de ADN: la densidad de la información y la estabilidad.

En el máximo teórico, un gramo de un solo código genético hebra puede codificar 455 exabytes de información. Eso es casi medio billón de terabytes, o 4.9 * 10 11 GB. (Como punto de referencia, la última iPad alcanza un máximo de 64 GB de espacio de almacenamiento.) Hebras de ADN también le gusta doblarse sobre sí mismos en la parte superior, lo que significa que, a diferencia de la mayoría de los otros medios de almacenamiento digital, los datos no tiene por qué limitarse a dos dimensiones, y ser capaz de almacenar datos en tres espacios se traduce a más de espacio libre.

El ADN es también increíblemente robusto, y con frecuencia es legible, incluso después de haber sido expuesto a condiciones desfavorables durante miles de años. Cada vez que los investigadores recuperan la información genética de un ejemplar de mamut lanudo , o la secuencia del genoma de un 5.300 años de edad, momia humana , que es un testamento a la durabilidad del ADN y la vida de los datos. Solo trata de recuperar archivos de un CD de 5.000 años de antigüedad o DVD. El infierno, lo intente con un disco de 20 años de edad, las probabilidades son simplemente no va a suceder.

Dicho esto, el ADN tiene sus defectos. "No se trata de re-escritura, no es de acceso aleatorio, y es una latencia muy alta", explica Kosuri ", así que realmente las aplicaciones son para el almacenamiento de archivos (no minimiza la importancia de los archivos)."
La solución (práctica)

Para demostrar el enorme potencial de almacenamiento de ADN, Kosuri y su equipo utilizaron apenas por debajo de 55.000 de 159 nucleótidos de fragmentos de un solo código genético de cadena para codificar un libro de 5,27 megabits, que contiene 53,426 palabras, 11 imágenes jpg y un programa JavaScript. A continuación, procedió a utilizar la próxima generación de técnicas de secuenciación de ADN para leerlo de nuevo. (Para aquellos que necesitan restauración, los nucleótidos son los bloques de construcción individuales que, cuando se unen, forman los filamentos de ADN.)

5,27 megabits probablemente no te parece mucho (que sale a unos 660 kilobytes de información, acerca de lo que encontrarías en un disquete de 3,5 "de los años 80), pero es impresionante por lo menos por tres razones:

Uno: Se aplasta positivamente la anterior de ADN de almacenamiento de registro de 7.920 bits.

Dos: El método de codificación utilizado por la novela de Kosuri y sus colegas les permitió abordar las cuestiones de coste y precisión, dos de larga data que enfrentan dificultades técnicas de almacenamiento de ADN:


La razón principal de por qué esto habría sido difícil en el pasado es que es muy difícil construir un gran tramo de ADN con la secuencia exacta, y que sea barato. Tomamos un enfoque que nos permite usar cadenas cortas de ADN (básicamente por tener una dirección (19 bits) y el bloque de datos (96 bits), por lo que cada tramo corto se pueden coser juntos más tarde después de la secuencia. Utilizando tramos cortos nos ha permitido aprovechar tanto la síntesis de nueva generación [de la escritura de datos] ... y secuenciación de próxima generación [de] la lectura de datos de tecnologías de coste muy bajo y facilidad.

Tres: Se ofrece una prueba convincente de concepto de que el ADN se puede utilizar para almacenar la información digital a densidades notables. "Lo que hemos publicado en términos de escala es ... obviamente pequeña en comparación con las tecnologías comerciales ahora", explica Kosuri, pero "utilizando nuestro método, un petabyte de datos [un petabyte = 1.024 terabytes] requeriría alrededor de 1,5 mg de ADN". Puesto que la información genética se pueden envasar en tres dimensiones, que se traduce en un volumen de almacenamiento de aproximadamente un milímetro cúbico .

La representación logarítmica ofreció para ilustrar cómo la densidad de almacenamiento demuestra Kosuri y su equipo (denominado "El Trabajo") se compara con las tecnologías de hoy y demañana. Usted realmente debe simplemente hacer referencia a la gráfica, pero resume a: ADN gana por goleada.

"Por ejemplo", explica Kosuri ", que son aproximadamente 10 órdenes de magnitud (100 000 000 000 veces) más densa que la de un CD, una más densa de un millón de veces superiores a las mejores tecnologías de almacenamiento comercial, y cerca de ~ 1000 veces más denso que el [otro ] prueba de concepto de trabajo (por ejemplo, los átomos de posición sobre una superficie). " Se dice que el secreto de la superioridad del ADN se remonta al hecho de que puede ser almacenado en seco en tres dimensiones; "por lo tanto no hay superficie que requiere un espesor, lo que realmente mata densidad de datos en 3D."
El futuro

Almacenamiento de ADN tiene sus limitaciones. Como mencioné anteriormente, no es regrabable, y no es de acceso aleatorio. Su latencia es demasiado alta para que sea práctico para otra cosa que el almacenamiento de archivos, pero ya hemos demostrado que estamos en gran necesidad de espacio para archivar, de todos modos. Los únicos otros grandes factores que limitan, en la actualidad, son la síntesis y las tecnologías de secuenciación - y los que no será un problema durante mucho más tiempo.

De acuerdo con Kosuri, los costos de la síntesis de ADN y la secuencia ha estado cayendo mucho más rápido que la ley de Moore. En la sección de información complementaria de su papel, y sus colegas Kosuri imaginar lo que un petabyte de almacenamiento que requieren, desde el punto de vista de la síntesis y los costos de secuenciación, y la conclusión de que sería necesario un orden más o menos 6 de la caída de magnitud en la secuenciación y 7 - 8 en la síntesis de los medios de almacenamiento de que la capacidad de llegar a ser viable.

"Para dar perspectiva", explica Kosuri, "los costos han estado decayendo durante los últimos 5-10 años en el año por 10 veces y 5 veces para la secuenciación y síntesis respectivamente." En otras palabras: esta tecnología está a la vuelta de la esquina. ¿Estás listo para su unidad de ADN?

Resultados de los investigadores se publican en el último número de la Ciencia .
Imágenes a través de Shutterstock

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INVESTIGACION DE ARCHIVO Y ADN: OBAMA DESCIENDE DE ESCLAVOS

Obama desciende de ancestros esclavos, dicen los investigadores
http://www.washingtonpost.com/ 31/07/2012
El presidente de Kenia de Obama / Kansas patrimonio lo hace acerca del modo más auténtico de África como uno puede ser, pero en algunos campos, sus "buena fe raciales" - hijo de un inmigrante africano y una madre blanca que lo crió en Asia y luego lo envió a crecer con sus abuelos blancos en Hawaii - sugieren que no es culturalmente "lo suficientemente negro".

Ahora bien, resulta que Barack Obama, al parecer, descendiente de un esclavo - en el lado de su madre.

La web de genealogía Ancestry.com sitio ha llevado a cabo investigaciones que dicen que confirma que Stanley Ann Dunham, la madre de Obama, es descendiente de un esclavo de Virginia históricamente significativo llamado John Punch. La investigación de archivo y el ADN del sitio Web apoya la teoría de que los descendientes de Punch, uno de los africanos muy pocos a principios de Virginia colonial, eran terratenientes blancos en Virginia y los antepasados ​​de Kansas, nacido en Dunham - que sería un-tatara-tatara-tatara-tatara tatara-tatara-tatara-tatara-tatara-tatara nieto del Golpe de mala suerte.

Golpe que se conoce a los historiadores a causa de un decreto de la corte 1647 de Virginia que lo convirtió en el ". Esclavizados de por vida", registró por primera vez en la historia de África del estado para estar legalmente

La decisión judicial que selló su destino surgió a partir de entonces la servidumbre legalmente permitido por contrato, un sistema común de draconiana a la vez que obligaba a los hombres pobres a los años de trabajo sin compensación a cambio de garantías agrarias y el pago de la deuda. Golpe ilegalmente escapó de su servidumbre, pero fue capturado y juzgado en Virginia, y fue condenado a la esclavitud de toda la vida (junto con "treinta" por franjas "castigo de los azotes").

A finales de ese siglo, un gran número de seres humanos secuestrados de África estaban siendo traídos por barcos holandeses e Inglés a la colonia de Virginia, donde el comercio de esclavos duró más de un siglo y medio. A pesar de esa "importación" de "personas" se prohibió oficialmente en 1808, la emancipación de los esclavos negros y sus hijos no vienen por otros 50 años.

Un amplio acceso a las pruebas de ADN y la investigación genealógica en los últimos años ha demostrado la herencia de raza mixta en muchas viejas familias blancas, así como la evidencia de los dueños de esclavos en las líneas de sangre de muchas familias negras, entre ellos Michelle Obama, como Rachel Swarns establece en el "American Tapestry , "su biografía sobre los antepasados ​​negros, blancos y multirracial de la primera dama.

Como mi colega Mary C. Curtis señaló recientemente, que la verdad no debe venir como una sorpresa. Hay muchas familias cuya experiencia americana se remonta, aunque las generaciones de los antepasados ​​trabajadores que soportaron la abominación de la esclavitud - o eran sus beneficiarios equivocadas. Parece probable que los estudios genealógicos con el tiempo confirmará que si nos remontamos lo suficiente en la historia de Estados Unidos, podemos encontrar pruebas de que, independientemente de nuestro color de piel, todos somos primos lejanos.

Tal vez el reconocimiento incluso conducir a poner fin a siglos de racismo y discriminación. Esperemos que no se llevará a otros 10 generaciones antes que eso suceda.

Bonnie Goldstein está en Twitter @ KickedByAnAngel.

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CON BASE EN INVESTIGACION DE ARCHIVOS Y TECNOLOGIA ADN SE INICIA IDENTIFICACION DE VICTIMAS DE PEARL HARBOR

Hombre de Taunton ha dado muestra de su ADN para ayudar a identificar a los miembros del servicio que murieron en Pearl Harbor
http://www.tauntongazette.com/ 16/05/2012
Un hombre de Taunton ha presentado recientemente una muestra de su ADN como parte de un esfuerzo del Departamento de Defensa para identificar a decenas de marineros no identificados que murieron durante el bombardeo de Pearl Harbor.

A mediados de abril, Al Sigfrido recibió una carta de la Marina de Guerra para informarle de que su ADN era necesario. Mientras Sigfrido conoce muy poco acerca de su tío, George Price, quien murió en el USS Oklahoma y no espera para saber más a través de las pruebas, se espera que sus esfuerzos pueden llevar consuelo a otras familias con parientes en el barco que nunca regresó a ellos.

"Es fascinante", dijo Siegfried, mientras que la realización de una muestra de ADN por vía oral con el equipo del Departamento de la Armada había enviado a él. "Tengo la esperanza de obtener algún tipo de resultados. Es para ayudar a darle un cierre a los muertos y los familiares de las así a través de un proceso de eliminación. "

Siegfried dijo que el proceso fue rápido y sin dolor. "Es fácil", dijo.

El POW / MIA, dice la oficina de 450 efectivos de la Marina y los Marines de 14 murieron en el USS Oklahoma. De este número, que dice 36 fueron identificados y enterrados, dejando 369 enterrado entre las incógnitas en el Cementerio Nacional Memorial del Pacífico en Honolulu.

Siegfried dijo que es difícil de expresar cómo se siente acerca de la pena.

"Es como abrir un frasco de la historia", dijo Siegfried, quien dijo que él también es un veterano de la guerra de Vietnam.

Los marineros que murieron en Pearl Harbor y que nunca fueron identificados se incluyen en un esfuerzo por parte de los prisioneros de guerra de Defensa / Oficina de Desaparecidos de Personal (DPMO), la oficina de la dirección del gobierno en relación POW / asuntos MIA, para dar cuenta de los miembros del servicio que faltan de los conflictos del pasado y las guerras. El Programa Conjunto de POW / MIA Contabilidad Comando Conjunto (CCPC) es el componente operativo y lleva a cabo la recuperación real y la identificación de los restos.

Katie Suich, especialista en relaciones públicas para la Marina de la Oficina de Personal Comando de Comunicaciones, dijo que esta ronda de trabajo con el ADN consiste en 61 de los marineros desconocidos que murieron en el USS Oklahoma. Ella dijo que la decisión de hacer la prueba de ADN a través del CCPC se produjo en 2003 después de una investigación de archivo conducido a nuevas incursiones en el descubrimiento potencial de las identidades de los marineros desconocidos.

"En junio de 2003, basada en la investigación de archivo, y los avances en la tecnología del ADN, el CCPC se inició la exhumación de ataúdes de USS Oklahoma incógnitas", dijo Suich. "Parte de este esfuerzo es tener una familia muestra ADN de referencia para hacer referencia a en contra de los restos y hacer las identificaciones. Por lo tanto DPMO dirigió la Armada para obtener (una muestra de ADN) de los miembros de la familia. "

Suich dijo obtención de ADN de las familias de quienes murieron en el de Oklahoma está en curso, pero no dio un calendario para los esfuerzos.

"Este programa es parte de la misión benévola para mantener la promesa de recuperar los que se hacen falta al servir a nuestra nación", dijo Suich. "Esta promesa solemne es a los marinos caídos que han hecho el sacrificio máximo y las familias de las víctimas que esperan el regreso de sus seres queridos".

En los Números: Pearl Harbor, el esfuerzo ID

2.402 El número de estadounidenses muertos durante el bombardeo de Pearl Harbor el 7 de diciembre de 1941.

1.282 El número de estadounidenses resultaron heridos durante el bombardeo de Pearl Harbor. 353 El número de combatientes japoneses, los bombarderos y aviones torpedo lanzado en dos oleadas de atacar Pearl Harbor.

450 El número de personal de la Marina que murieron en el USS Oklahoma durante el bombardeo de Pearl Harbor.

369 El número de incógnitas de la USS Oklahoma, que permanecen enterrados en el Cementerio Nacional del Pacífico en Honolulu.

61 El número de ataúdes en el Cementerio Nacional Memorial del Pacífico en Hawai, que contiene los restos desconocidos de los cuerpos de los marineros que murieron en el USS Oklahoma como consecuencia de los bombardeos de Pearl Harbor que el PAC (Programa Conjunto de POW / MIA Comando de Contabilidad) es en la actualidad tratando de identificar mediante pruebas de ADN.

¿Qué es el ADN?
Los científicos forenses pueden tomar muestras de sangre, saliva, piel o cabello para que coincida con otras muestras, en un proceso formal denominado como el análisis de ADN.
ADN significa ácido desoxirribonucleico, que es un ácido nucleico que contiene las instrucciones genéticas, al igual que los planos , para el desarrollo y el funcionamiento de todos los organismos vivos. Secuencias o formaciones del ácido contienen la información genética, llamados genes.

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